具有較強(qiáng)的科技創(chuàng)新能力。有中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合3個(gè)博士后科研流動(dòng)站，設(shè)有4個(gè)研究所、6個(gè)研究室，2個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室，3個(gè)山東省工程技術(shù)研究中心。“十一五”以來(lái)，共承擔(dān)廳局級(jí)以上科研課題739項(xiàng)，其中國(guó)家級(jí)項(xiàng)目143項(xiàng)。在省屬高校中首家主持國(guó)家“973”項(xiàng)目1項(xiàng)，承擔(dān)“973”項(xiàng)目課題3項(xiàng)，牽頭國(guó)家“十一五”科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目4項(xiàng)，財(cái)政部“中醫(yī)藥古籍保護(hù)與利用能力建設(shè)”重大專(zhuān)項(xiàng)1項(xiàng)；國(guó)家重大、重點(diǎn)科研項(xiàng)目累計(jì)科研經(jīng)費(fèi)突破1億元，中醫(yī)臨床研究基地建設(shè)資金2.8億元；獲國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)2項(xiàng)，省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)78項(xiàng)、廳局級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)77項(xiàng)。是科技部認(rèn)定的“國(guó)家科技成果重點(diǎn)推廣項(xiàng)目技術(shù)依托單位”、“國(guó)家中藥現(xiàn)代化、產(chǎn)業(yè)化規(guī)范種植項(xiàng)目承擔(dān)單位”。

學(xué)校注重加強(qiáng)學(xué)科建設(shè)，形成了一批優(yōu)勢(shì)和特色學(xué)科。現(xiàn)有中醫(yī)基礎(chǔ)理論、中醫(yī)醫(yī)史文獻(xiàn)2個(gè)國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科和中醫(yī)內(nèi)科學(xué)1個(gè)國(guó)家重點(diǎn)（培育）學(xué)科。1個(gè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，1個(gè)國(guó)家衛(wèi)生部技術(shù)準(zhǔn)入專(zhuān)科；國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科12個(gè)、重點(diǎn)專(zhuān)科(專(zhuān)病)3個(gè)、重點(diǎn)建設(shè)專(zhuān)科5個(gè)、重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室6個(gè)；有山東拾泰山學(xué)者”崗位學(xué)科6個(gè)，山東省人文社科研究基地1個(gè)，省級(jí)重點(diǎn)學(xué)科、重點(diǎn)專(zhuān)科、重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等14個(gè)。

學(xué)校，以鄧小平理論和“三個(gè)代表”重要思想為指導(dǎo)，深入貫徹落實(shí)科學(xué)發(fā)展觀和黨的教育方針，以建設(shè)高水平特色名校為目標(biāo)，以科學(xué)發(fā)展為主題，以人才培養(yǎng)為根本任務(wù)，以提高質(zhì)量和科技創(chuàng)新為主線，以解放思想、深化改革為動(dòng)力，凝聚全校師生的力量，統(tǒng)一思想，搶抓機(jī)遇，突出特色，奮發(fā)進(jìn)取，以高昂的斗志、扎實(shí)的工作，全面推進(jìn)高水平特色名校建設(shè)，正在為實(shí)現(xiàn)山東中醫(yī)藥大學(xué)新的歷史性跨越而努力奮斗！